Sekretariat Badan Penghubung Provinsi Bengkulu merupakan unsur pendukung yang mempunyai tugas menyelenggarakan koordinasi, administrasi, perencanaan, keuangan, kepegawaian, perlengkapan, ketatausahaan, serta pelayanan umum guna mendukung kelancaran pelaksanaan tugas dan fungsi Badan Penghubung.

Dalam menjalankan tugasnya, Sekretariat berperan memastikan seluruh proses administrasi organisasi berjalan secara efektif, efisien, transparan, dan akuntabel sesuai dengan ketentuan peraturan perundang-undangan.